News：阪大とNECなど、XMLベースのたんぱく質DB公開実験

News：ニュース速報

2003年7月8日　06:50 PM 更新

　大阪大学蛋白質研究所（PDBj）とNEC、ビーコンインフォメーションテクノロジー、三井物産は7月8日、XMLベースのたんぱく質立体構造データベース（PDB）をネット公開する実験を始めたと発表した。

　PDBは日米欧で運営し、現在約2万1000のデータが格納されている。これまでは専用フォーマットを利用していたが、XML化することでデータの再利用が簡単になる上、XQueryを使用することで検索性を高めることができるとしている。

　実験は約3カ月間を予定。アクセス頻度やシステム負荷、処理時間などの情報を収集、分析する。XML化のメリットを確認することで、バイオ分野のデータベースでXMLの普及促進を図る。

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PDBj「XML database open experimental site」

[ITmedia]

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