
企業にとって年末調整業務は、従業員全員に関わる重要な業務である一方で、大量の紙の申告書や複雑な計算、頻繁な法令改正への対応など、人事労務部門に大きな負担を強いる季節業務の代表格です。特にリモートワークの普及により紙でのやり取りが困難になるなどで「デジタル化のニーズ」が急速に高まっています。
こうした課題を解決し、業務の効率化と法令順守を両立させるのが年末調整システムです。
本記事では、実際にシステムを導入・利用しているユーザーの評価に基づき、ユーザー評価・満足度の高い年末調整システム・製品をランキング形式でご紹介。併せて、実際にツールを導入・活用しているユーザーの評価を参考に、導入を成功させるためのポイントについても解説します。ツールの特徴を理解し、自社のビジネスを加速させるツール選定の一助としてください。
※本ランキングと製品満足度は
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機能比較で探す!「年末調整システム」おすすめ製品一覧
年末調整とは?
年末調整とは、企業が毎月の給与から源泉徴収している所得税の合計額と、本来従業員が支払うべき年間の所得税額を比較し、その差額を精算する手続きのことを指します。これらのデータ化、および工程をデジタル化し効率よく、確実に進めていけるようにするためのツールが年末調整システムです。
納税額の正しい計算
年末調整は、年間の給与が確定した時点で従業員の各種控除(生命保険料、地震保険料、扶養親族など)を考慮に入れ、正しい年間の所得税額を再計算します。これにより、従業員の所得税の過不足を調整し、徴収しすぎた分は還付、不足分は追加徴収されます。
企業の法的義務
所得税法に基づき、給与を支払う企業(源泉徴収義務者)は、原則として全従業員に対して年末調整を実施することが義務付けられています。正確かつ期限内に手続きを完了させることは、コンプライアンス上の重要事項です。
詳細はこの1ページで解決!「年末調整システム」の主な機能、メリット・デメリット、製品選定のポイントを分かりやすく解説

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「年末調整システム」製品満足度ランキング【2025年9月版】
※本ランキングと製品満足度は
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ジンジャー年調収集オプション
詳細と利用者の口コミを見る労務管理クラウド「ジンジャー」シリーズのオプション機能で、従業員からの申告情報や控除証明書データをWebで収集・一元管理する機能を実装。ペーパーレス化と入力負荷削減を実現し、人事担当者の確認工数を大幅な短縮が見込める。
年末調整申告支援サービス 年調ヘルパー
詳細と利用者の口コミを見る従業員がWeb上で簡単に申告書を作成・提出できるクラウドサービス。質問形式で迷いなく入力できるUIを軸に、過去データの自動連携などの機能とともに企業の年末調整業務を支援する。
オフィスステーション年末調整
詳細と利用者の口コミを見るクラウド型労務管理システム「オフィスステーション」シリーズの一部で、年末調整のPC・スマートフォンから申告・提出、行政への電子申請に対応。社会保険労務士などの専門家にも利用されているという機能性も強み。
(4) Mominoki
詳細と利用者の口コミを見る企業の規模や業種を問わず利用できる年末調整クラウドシステム。従業員はスマートフォンやPCから簡単に入力・提出でき、管理者側は進捗管理やデータチェックの負担軽減を実現できる。
(5) freee人事労務
詳細と利用者の口コミを見る給与計算や勤怠管理と連携した統合型クラウド人事労務シリーズで、年末調整機能も搭載。シリーズ間でのデータ連携、複雑な計算の自動化など、従業員側/管理側ともに操作負担を最小限に抑える機能性が強み。
このほかにもおすすめの製品があります。搭載機能や特徴、評価/口コミ数などで絞り込み/並べかえができる「おすすめ年末調整システム一覧&検索&比較コーナー」をぜひお試しください。またITセレクトでは、IT製品・サービス選定に詳しい専門スタッフに聞ける「ITセレクトのコンシェルジュ相談サービス(無料)」も用意しています。こちらもぜひご活用ください!
併せてチェック!勤怠管理システム59製品をタイプ別に徹底比較|ぴったりな製品の無料診断付きでチェック
年末調整システム導入のメリット
年末調整システムを導入することで、人事労務部門の負担軽減だけでなく、企業全体のコンプライアンス強化にもつながるメリットが期待できます。
- 紙の削減とコストダウン
- 従業員の入力負荷軽減
- 法令改正への確実な対応
紙の削減とコストダウン
従業員からの申告書や控除証明書を電子データとして収集・管理することで、紙の印刷・配布・回収にかかる時間とコストが削減されます。また、保管スペースの確保やファイリング作業も不要になります。
従業員の入力負荷軽減
システムが用意した質問に答える形式で申告が進められるため、従業員が複雑な法令や申告書の書き方に迷うことがなくなります。過去のデータ自動連携機能などにより、従業員側の入力時間も大幅に短縮されます。
法令改正への確実な対応
税制や社会保険に関する法令改正は頻繁に行われますが、クラウド型のシステムであれば自動でアップデートが行われます。これにより、人事担当者が都度、法令を確認し、手作業で計算ロジックを変更する手間とリスクを解消できます。
成功へつなぐ年末調整システム選定のチェックリスト
年末調整システムを選ぶ際は、単に申告書を作成できるだけでなく、業務全体を効率化し、長期的な法令対応に耐えうる機能を持つかを確認することが重要です。
- 申告書データの収集機能
- 他システムとの連携性
- セキュリティと電子申告への対応
申告書データの収集機能
従業員が容易に利用できるインターフェース(PC/スマートフォン対応)を持ち、控除証明書などの必要書類を画像アップロードなどで電子的に収集できる機能があるかを確認しましょう。
他システムとの連携性
給与計算システムや人事情報データベースとシームレスに連携できるかを確認します。データ連携が手動の場合、転記ミスや二重入力のリスクが残るため、API連携などによる自動化が不可欠です。
セキュリティと電子申告への対応
マイナンバーなど機密性の高い情報を扱うため、セキュリティ対策(アクセス制限、暗号化など)が万全であることを確認します。さらに、税務署への「電子申告」に標準で対応しているかどうかも重要な選定基準となります。
おすすめSaaS導入前に考慮しておくべき3つの基本ポイント
年末調整システム人気ランキングのまとめと今後のチェックポイント
年末調整システムは、労働環境が変化し、法令遵守がより厳格になる現代において、人事労務部門の業務を支える基盤システムとなりつつあります。
本記事でご紹介したユーザー満足度ランキングは、多くの実務担当者によって高く評価された製品群であり、システム選定の有力な指標となるでしょう。
今後は、AIによる申告内容の自動チェックやマイナポータル連携による控除証明書データの自動取得機能のような機能/精度向上も進んでいくとみられます。最新技術を取り入れ、従業員の利便性と管理側の負担軽減を両立できる拡張性の高いシステムを選ぶことが、今後のチェックポイントとなります。
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